Menù principale
B024459 - BIOLOGIA COMPUTAZIONALE
Principali informazioni
Lingua Insegnamento
Contenuto del corso
Libri di testo consigliati
Obiettivi Formativi
Prerequisiti
Metodi Didattici
Modalità di verifica apprendimento
Programma del corso
Anno Accademico 2019-20
Coorte 2017 - Laurea Triennale (DM 270/04) in BIOTECNOLOGIE
Anno di corso
Terzo Anno - Primo Semestre
Dipartimento di Afferenza
Medicina Sperimentale e Clinica
Modulo di sola Frequenza di
Settore Scientifico disciplinare
MED/46 - SCIENZE TECNICHE DI MEDICINA DI LABORATORIO
Crediti Formativi
3
Ore Didattica
24
Periodo didattico
30/09/2019 ⇒ 20/12/2019
Frequenza Obbligatoria
No
Tipo Valutazione
Giudizio Finale
Contenuto del corso
mostra
Programma del corso
mostra
Docenza
Lingua Insegnamento
Italiano
Contenuto del corso
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio del Genoma
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio del Trascrittoma
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio dell’ Epigenoma
Integromica e Network Biology
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio del Trascrittoma
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio dell’ Epigenoma
Integromica e Network Biology
Libri di testo consigliati (Cerca nel catalogo della biblioteca)
Come materiale didattico saranno fornite dal docente le diapositive delle lezioni
Obiettivi Formativi
Conoscere le principali tecniche sperimentali “omiche” per lo studio del genoma, metiloma, trascrittoma e proteoma e gli approcci computazionali per analizzare e integrare i dati generati da tali tecniche.
Prerequisiti
Conoscenze di algebra lineare e teoria delle probabilità sono utili ma non strettamente necessarie.
Metodi Didattici
Lezioni teorico/pratiche ed esercitazioni in laboratorio di informatica (a piccoli gruppi).
Modalità di verifica apprendimento
Esame orale sul programma svolto, eventualmente preceduto dall'esposizione di una tesina scritta.
Programma del corso
Genomica
Il genoma umano
Classificazione delle varianti genomiche
Tecnologie array per lo studio della varianti genomiche
Tecnologie di sequenziamento di seconda generazione per lo studio della varianti genomiche
Tecnologie di sequenziamento di terza generazione per lo studio della varianti genomiche
Trascrittomica
Il trascrittoma umano
Tecniche array per lo studio dell’espressione genica
Tecniche di sequenziamento per lo studio dell’espressione genica.
Metodi statistici per lo studio dell’espressione differenziale.
Clustering per l’identificazione di geni coespressi.
Enrichment analysis.
Epigenomica
Le modificazioni del genoma umano.
Tecniche array e tecniche di sequenziamento per lo studio del metiloma.
Metodi computazionali per lo studio delle regioni differenziamento metilate.
Network Biology
Introduzione alle tecniche per lo studio dell’interazione funzionale proteina-proteina (Yeast-two hybrid, Synthetic Lethality, Synthetic Rescue, ).
Concetti di Functional coupling. Elementi di network theory. Elementi di network medicine.
Il genoma umano
Classificazione delle varianti genomiche
Tecnologie array per lo studio della varianti genomiche
Tecnologie di sequenziamento di seconda generazione per lo studio della varianti genomiche
Tecnologie di sequenziamento di terza generazione per lo studio della varianti genomiche
Trascrittomica
Il trascrittoma umano
Tecniche array per lo studio dell’espressione genica
Tecniche di sequenziamento per lo studio dell’espressione genica.
Metodi statistici per lo studio dell’espressione differenziale.
Clustering per l’identificazione di geni coespressi.
Enrichment analysis.
Epigenomica
Le modificazioni del genoma umano.
Tecniche array e tecniche di sequenziamento per lo studio del metiloma.
Metodi computazionali per lo studio delle regioni differenziamento metilate.
Network Biology
Introduzione alle tecniche per lo studio dell’interazione funzionale proteina-proteina (Yeast-two hybrid, Synthetic Lethality, Synthetic Rescue, ).
Concetti di Functional coupling. Elementi di network theory. Elementi di network medicine.