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B024458 - BIOCHIMICA COMPUTAZIONALE
Principali informazioni
Lingua Insegnamento
Contenuto del corso
Libri di testo consigliati
Obiettivi Formativi
Prerequisiti
Metodi Didattici
Modalità di verifica apprendimento
Programma del corso
Anno Accademico 2018-19
Coorte 2016 - Laurea Triennale (DM 270/04) in BIOTECNOLOGIE
Anno di corso
Terzo Anno - Primo Semestre
Dipartimento di Afferenza
Medicina Sperimentale e Clinica
Modulo di sola Frequenza di
Settore Scientifico disciplinare
BIO/10 - BIOCHIMICA
Crediti Formativi
3
Ore Didattica
24
Periodo didattico
01/10/2018 ⇒ 30/04/2020
Frequenza Obbligatoria
No
Tipo Valutazione
Giudizio Finale
Contenuto del corso
mostra
Programma del corso
mostra
Docenza
Lingua Insegnamento
Italiano
Contenuto del corso
Teoria e pratica di analisi delle sequenze biologiche. Allineamenti a coppie e multipli. Matrici di scoring e modellazione degli allineamenti mutipli. pathway biochimici e biologici, processi di sistema e loro metodi di studio.
Libri di testo consigliati (Cerca nel catalogo della biblioteca)
Fondamenti di bioinformatica - Krane e Raymer
Introduction to Bioinformatics - Lesk
Materiale del proiettato dai docenti.
Introduction to Bioinformatics - Lesk
Materiale del proiettato dai docenti.
Obiettivi Formativi
Il corso si propone di fornire nozioni relative alle principali tematiche di tipo comutazionale relative all'analisi biochimica. Nello specifico, lo studente imparerà la teoria della comparazione delle sequenze proteiche e della formazione dei concetti di famiglie proteiche, che verranno consolidate mostrando metodi e procedure per il loro utilizzo nell'analisi dei percorsi metabolici e di segnalazione cellulari.
Queste nozioni sono estremamente attuali nel campo delle biotecnologie e rappresentano per lo studente un obiettivo formativo innovativo.
Queste nozioni sono estremamente attuali nel campo delle biotecnologie e rappresentano per lo studente un obiettivo formativo innovativo.
Prerequisiti
Nozioni di biochimica e biologia molecolare e cellulare
Metodi Didattici
Lezioni frontali con materiale elettronico.
Modalità di verifica apprendimento
Esame orale alla presenza dei tre docenti del corso Biochimica e Biologia computazionale, in cui si valuterà la conoscenza del programma completo e della capacità di integrare aspetti computaizonali e concetti di biochimca e biologia cellulare pregressi. Al candidato verrà inoltre chiesto di ideare un esperimento -omico e di descrivere le principali metodologie e risultati attesi.
Programma del corso
Analisi delle sequenze biologiche. Ricerca di similarita’ di sequenza. Allineamenti a coppie esaustivi ed euristici. Allinemaneti multipli e profili. Matrici posizionali di scoring e modelli di Markov. Ricerca di domini funzionali nelle proteine. Banche dati di interesse biochimico e funzionale. Tipologie di comunicazione cellulare. I livelli extracellulare ed intracellulare.
Recettori di membrana o intracellulari dei segnali. I segnali intracellulari: secondi messaggeri classici, atipici, adattatori, enzimi.
I pathway di segnalazione: cascate di segnalazione sequenziali o clustering fisico, recruitment. Integrazione del segnale: segnali multipli, sinergici o meno. Proliferazione cellulare: descrizione del fenomeno e potenziali hub
Motilita’ cellulare: descrizione del fenomeno e potenziali hub
Adesione cellulare: descrizione del fenomeno e potenziali hub
Apoptosi: descrizione del fenomeno e potenziali hub
Recettori di membrana o intracellulari dei segnali. I segnali intracellulari: secondi messaggeri classici, atipici, adattatori, enzimi.
I pathway di segnalazione: cascate di segnalazione sequenziali o clustering fisico, recruitment. Integrazione del segnale: segnali multipli, sinergici o meno. Proliferazione cellulare: descrizione del fenomeno e potenziali hub
Motilita’ cellulare: descrizione del fenomeno e potenziali hub
Adesione cellulare: descrizione del fenomeno e potenziali hub
Apoptosi: descrizione del fenomeno e potenziali hub